Το ΚΕΕΑ υπάγεται στο Υπουργείο Παιδείας και Πολιτισμού. Αποστολή του ΚΕΕΑ είναι η προώθηση και καθιέρωση της έρευνας, καθώς και η δημιουργία ερευνητικής υποδομής στο κυπριακό εκπαιδευτικό σύστημα.
Οι τρεις πυλώνες δράσης του ΚΕΕΑ είναι:
(α) η Έρευνα, (β) η Προώθηση της Ερευνητικής Κουλτούρας και (γ) η Αξιολόγηση.